肛門指診又稱為直腸指診，通常是專科醫師會先詳細詢問患者的家族史或是症狀，評估之後，戴上塗有潤滑劑的手套後，以手指探入病人肛門進入直腸，直接接觸到攝護腺，以觸診加上醫師的經驗判斷攝護腺的大小與是否有不明硬塊或是結節的現象。這種肛門指診是最傳統且簡單的攝護腺理學檢查，通常都是憑藉醫師本身的經驗與觸感，所以診斷較個人，有時會做出較不客觀的判斷。