目前食品檢驗中質譜儀是常用於化學分析的一種儀器，利用量測帶電粒子質量∕電荷（m/z）對其進行排序的分析技術，可分析出複雜的化學物質組成和結構，並根據分子的精確質量進行鑑定及定量分析。以禽畜水產品中的動物用藥檢測為例，質譜儀搭配適當的萃取淨化前處理技術，能夠精確地識別複雜樣品中(如肌肉、內臟、蛋類等)的微量藥物成分，以此檢測動物用藥的殘留量是否符合規定。
 
    除了能精準分析出目標藥物，質譜儀的另一大特點為可同時檢測大量的分析物。以食藥署食品中多重殘留農藥檢驗方法來說，利用液相層析串聯質譜儀及氣相層析串聯質譜儀能同時分析出總計多達410項農藥，不僅能大幅降低時間成本，也可減少檢驗次數而兼具環保功能，因此被廣泛應用於各項領域，目前已是現代分析化學中不可或缺的工具之一。
    衛生局將持續配合食品藥物管理署不斷精進檢驗技術，並搭配精密儀器，為本縣食品安全嚴格把關。

參考資料：食品藥物管理署藥物食品安全週報