痢疾阿米巴世界性分布感染，但以熱帶、亞熱帶開發中國家之感染較普遍，長期集體生活之孤兒院、教養院、收容所、監獄為易發之場所，台灣地區調查發現山地原住民、教養院及精神病患收容所，感染情形較為普遍，此與衛生狀況有相當密切關係。另外男同性戀者，以及到疫區旅遊回國者均屬易感染者。近來常見發生於外籍勞工及外籍新娘。
痢疾阿米巴（ Entamoeba histolytica ）是人類最主要的腸道致病性原蟲，它能侵犯破壞腸道組織，有時可穿透腸壁隨血液循環至內臟器官，嚴重時可導致死亡，其形態和某些非致病之腸內共生性原蟲，如大腸阿米巴（ E. coli ）、哈氏阿米巴（ E. hartmanni ）極易混淆，有致病與非致病型兩類之分，在形態上無可分辨，一般而言，約有九成之患者為感染非致病型痢疾阿米巴之囊體（ cyst ），由於目前尚無簡易可行的試驗方式可區分兩者，所以從臨床的觀點來說，應假定皆為病原。
大腸受到痢疾阿米巴感染時，可有不同臨床類型，從無症狀帶蟲者、輕微及慢性腹瀉型，到爆發性下痢型，腸外感染也可能發生，以肝膿瘍最為普遍，目前對此疾病之確認，仍以顯微鏡型態檢查鑑定其囊體（ cyst ）或活動體（ trophozoite ）為唯一可行方法，囊體排泄期間均為可傳染期，在疾病的慢性期、恢復期及無症狀帶蟲者，均會排泄囊體，而患病的急性期如糞便中僅排出活動體則不具傳染性，痢疾阿米巴其潛伏期之長短極為懸殊，可由數日至數月以上不等。
糞便中之本蟲囊體所污染的飲用水可引發大規模之流行，但一般之感染均從不潔之手或飲食中沾染囊體經口而感染，因此推廣民眾之衛生教育、家庭廢水之妥善處理、注意飲食衛生及手之清潔，均為防止感染之方法，而帶蟲者除治療外，尤需教導注意便後洗手。
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