為因應環境變遷與生產成本提高，基因改造食品被賦予了「抗蟲」、「耐旱」、「高油酸」、「耐農藥」等特性，而目前全球生產基因改造之作物以「玉米」和「黃豆」比率最高，且由美國、巴西、阿根廷為前三大輸出國；我國平均每年進口黃豆約240萬噸與玉米約430萬噸，目前已開放基因改造玉米及基因改造黃豆之原料進口，有鑑於國人飲食習慣與特性，衛生福利部要求基因改造食品必須先經過檢驗與查驗登記，核發許可證後方能進口，且針對基因改造食品之標示也有明確之規範。
完整包裝之基因改造食品，須於外包裝上完整標示相關訊息，而依照產品性質受不同之規範:
一、強制標示：基因改造黃豆或玉米為原料佔最終產品總重量5%以上之食
品，必須強制標示「基因改造」或「含基因改造」。
二、容許殘留範圍，免除標示：非基因改造之黃豆或玉米，若因採收、儲
運，或其他因素摻雜有基因改造之黃豆或
玉米未超過5%，且此等摻雜非屬有意摻入
者，得視為非基因改造黃豆或玉米。
三、豁免標示：醬油、黃豆油、玉米油、玉米糖漿、玉米澱粉，因不含有
轉殖基因或蛋白質，得免標示。
四、自願標示：以非基因改造黃豆或玉米為原料之食品，得標示「非基因
改造」或「不是基因改造」。

我國自民國91年起納入基因改造食品管理，每年均針對國內產品及進口原料進行監測，並執行標示管理，目前並規劃於民國104年開始實施「散裝」基因改造食品之標示管理，以確實管控基改食品，並落實民眾食品安全。