有關媒體報導某年輕學生打過4劑B型肝炎疫苗後，仍罹患急性B型肝炎乙案，讓疫苗效力備受質疑，針對疫苗接種後抗體維持狀況，疾病管制局持續追蹤並進行許多相關研究。據初步資料顯示，B型肝炎疫苗於接種後15至18年後，未具B型肝炎抗體者，追加一劑疫苗後，仍有少部分不會產生抗體，是否代表已完全不具保護力，尚待進一步研究確認。惟近來台灣衛生環境提升，病毒暴露機會下降，且一歲以下感染者日後帶原機會才較高，故行政院衛生署肝炎防治委員經多次討論，建議目前無須全面再追加一劑疫苗，世界衛生組織目前亦持相同的看法。惟醫護人員或家中有B型肝炎帶原者等高危險群，可檢驗是否仍有抗體，若為陰性者建議向醫師諮詢是否自費補種。
預防B型肝炎，除了疫苗接種外，請民眾注意血液及體液的傳染亦十分重要。衛生局呼籲民眾避免接觸高危險性之行為如：使用消毒不完全之器械進行刺青、紋眉、穿耳洞等、不安全之性行為及共用針頭、刮鬍刀等，將可遠離B型肝炎病毒的感染。
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